RM8461用于蛋白質(zhì)組學(xué)的人肝臟標(biāo)準(zhǔn)品(NIST)旨在支持復(fù)雜樣品中肽和蛋白質(zhì)鑒定的研究，例如基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)中的那些。 RM 8461 可用于幫助評(píng)估實(shí)驗(yàn)室內(nèi)肽和蛋白質(zhì)鑒定的可信度或?qū)嶒?yàn)室之間或不同測(cè)量方法之間的可比性。 RM 8461 還可用于開發(fā)和驗(yàn)證用于識(shí)別肽和蛋白質(zhì)的新研究方法。

描述：

一個(gè) RM 8461 單元由一個(gè)裝有約 0.5 克凍干人肝材料的小瓶組成。

非認(rèn)證值：

生產(chǎn) RM 8461 是為了提供復(fù)雜的人體組織樣本，用于評(píng)估與液相色譜 (LC) 耦合的蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜儀器的性能、蛋白質(zhì)和肽鑒定軟件以及樣品制備方法的開發(fā) [1 ]。選擇肝組織以提供“標(biāo)準(zhǔn)化"范圍的蛋白質(zhì)豐度并提供樣本復(fù)雜性以覆蓋色譜“空間"。非認(rèn)證值不提供對(duì)國(guó)際單位制 (SI) 或其他高階參考系統(tǒng)的計(jì)量溯源性 [2]。 RM 8461 中存在的已鑒定蛋白質(zhì)的未經(jīng)認(rèn)證的定性值在表 1 中作為 UniprotKB [3] 登錄號(hào)列出。

儲(chǔ)存：RM8461用于蛋白質(zhì)組學(xué)的人肝臟標(biāo)準(zhǔn)品(NIST) 應(yīng)儲(chǔ)存在受控的室溫（20 °C 至 25 °C）下，避免陽(yáng)光直射，直至需要。

使用：在取出測(cè)試部分進(jìn)行分析之前，應(yīng)*混合內(nèi)容物。建議使用等于或大于 1 mg 的分析測(cè)試部分。

分析：對(duì)于蛋白質(zhì)特性等定性測(cè)量，不能使用符合 JCGM GUM 的測(cè)量不確定度的常規(guī)評(píng)估和表達(dá)。表 1 列出了使用鑒定算法建立的 1619 種蛋白質(zhì)的身份，其可靠性得到該領(lǐng)域?qū)＜业钠毡檎J(rèn)可。 RM 8461 中鑒定的蛋白質(zhì)是使用多個(gè)搜索引擎和多種樣品制備方法從自下而上的蛋白質(zhì)組學(xué)分析中推斷出來(lái)的。從 8 罐 RM 8461 的單個(gè) 1 mg 制劑 (n = 3) 中過(guò)濾出常見(jiàn)的蛋白質(zhì)，并重復(fù)注射 (n = 3)。僅當(dāng)滿足以下條件時(shí)才包含蛋白質(zhì)：

• 錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率 (FDR) 低于 5 %，

• 整個(gè)測(cè)量組的光譜豐度優(yōu)于 20% CV（包括技術(shù)和工藝重復(fù)分析），

• 在RM 8461 的整個(gè)生產(chǎn)過(guò)程中，使用Sequest HT、Mascot、MSAmanda 和Byonic 算法從八個(gè)罐子的分層隨機(jī)抽樣中鑒定出至少三種*的肽。

NIST 確信表 1 中列出的 1619 種蛋白質(zhì)的非認(rèn)證定性值符合所有標(biāo)準(zhǔn)。